O Município de São Gonçalo do Rio Preto localiza-se no nordeste do Estado de Minas Gerais, na Mesorregião do Jequitinhonha. Faz divisa ao norte com Senador Modestino Gonçalves; ao leste com Felício dos Santos; e ao oeste e ao sul com Couto de Magalhães de Minas. A sede municipal encontra-se a 788 metros de altitude e dista 53 km da cidade de Diamantina e 343 km de Belo horizonte, capital do estado, sendo acessada a partir dessa cidade, por rodovias pavimentadas BR-040, BR-135, BR-259, BR-367 e MG-214, com sede nas coordenadas geográficas 18º 00′ 15″ S de latitude e 43º 23′ 27″ W de longitude.